Silnika krokowego nie można nagle rozpędzić ani zahamować bez utraty synchronizacji. O ile podczas takiego dramatycznego startu silnik zwyczajnie może się zablokować tzn. nie ruszy, co jest widoczne gołym okiem, o tyle podczas podobnego hamowania "usterka ruchu" jest niewidoczna. Siłą inercji wirnika silnik może wykonać do kilku kroków, w zależności od wielkości prędkości obrotowej, przy której nastąpiło odcięcie impulsów STEP w związku z zadziałaniem E-stop. Może się zdarzyć, że podczas awaryjnego zatrzymania prędkość obrotowa silników była na tyle mała, że utrata kroku nie nastąpiła.
Jeśli Twoja maszynka napędzana była by serwami, wówczas nic podobnego nie zdarzyło by się.
Oczywiście rozwiązanie jest możliwe ale wymaga trochę pracy.
Należy napisać makro, które w chwili zgaśnięcia palnika zapamięta pozycję lub wiersz programu, po czym zaczeka na uruchomienie palnika, wycofa go do odpowiedniej pozycji i ponowi proces cięcia. Informacja o zgaszeniu palnika nie może być włączona do E-stop. Jeden z pinów wejściowych LPT musi być do tego przeznaczony i jednocześnie odczytywany przez makro. Oczywiście działanie tej funkcji może a wręcz powinno odbywać się bez angażowania operatora.
Brzmi prosto, jednak osobiście nie napiszę Ci takiego makra (jestem na nieco innym poziomie budowy mojej maszynki).
Na forum mamy wielu doświadczonych specjalistów, którzy pewnie pomogą.

Rozumiem, że zgaśnięcie palnika powoduje awaryjne zatrzymanie maszyny E-stop? Jeśli maszyna jest na silnikach krokowych, to odpowiedź pewnie już znasz - silnika takiego nie można zatrzymać nagle, proces ten musi odbywać się po rampie "zaszytej" w programie sterującym.