Źle postawiłeś pytanie.
Skoro zmierzyłeś już że różnica wynosi 1mm, to wiesz jak to ustawić (czyli: aż wyjdzie 0).
Pytanie tylko jak to przesunąć i usztywnić w nowym położeniu.
Nic nie napisałeś o tym jakie to są prowadnice, jak zamocowane, jak podparte, jak obrabiałeś powierzchnie pod te prowadnice, itp. W związku z tym nie da Ci się w tym momencie pomóc.