Zastanów się nad zamontowaniem silnika i śruby napędowej na stole, a mocowania nakrętki na podstawie - tak jak w maszynach firmy Bakprint. Mogło by to ułatwić i poprawić mocowanie łożysk liniowych do podstawy.

Usztywnij boki bramy przykręcając jakiś profil alu albo gruby płaskownik. Zmienił bym też umiejscowienie łożysk osi Z na krzyżaku tak aby nie ograniczały wysokości detalu, założysz imadło i może braknąć miejsca...
Pod całą dolną ramę też nie zaszkodziło by dać blachy nawet 5mm, powinno usztywnić całość.

Jeśli nie masz jeszcze prowadnic liniowych i reszty to warto zastanowić się nad takim albo podobnym zestawem z ebay: http://www.ebay.de/itm/DE-STOCK-SBR20-L ... Sw8GtZSi35

Wykorzystaj w pełni możliwości Fusiona i spróbuj zrobić kilka symulacji wtedy sam zobaczysz gdzie można coś usztywnić itp.