Nie istnieją takie ustawienia, żeby ustalić inne parametry ruchu w dół niż w górę, albo do przodu niż w tył. Gdybyś popieprzył w ustawieniach, toby maszyna się przeskalowała, ale wracała tam skąd wyruszyła.
Nie znam innej przyczyny gubienia pozycji niż gubienie kroków, ale znowu, gdyby to gubienie było na poziomie komputer/sterownik, toby w obie strony działało tak samo.
Raczej masz klasyczny przypadek, że w jedną stronę jedziesz G1 i kroków nie gubisz, a wracasz G0 i kroki gubisz, bo masz za szybko albo za stromą rampę.