Tu moim zdaniem problem leży nie w EMC, tylko w warstwie pośredniej - czyli w sterowniku, który dane z EMC przetransponuje na polecenia dla falownika. Bo z tego co się orientuję, EMC tylko wysyła sygnały do silników, i nijak nie sprawdza, czy zostały wykonane. Czyli to, co wyświetla na ekranie jako położenie osi, bierze się nie z jakiegoś pomiaru, ino z domysłu, że wrzeciono jest tam, gdzie mu nakazano.

Słowem - należałoby stworzyć sterownik, który zasymuluje działanie silnika krokowego. Czyli dostając na wejściu "zrób x kroków w lewo" uruchomi falownik w lewo i zatrzyma go po przejściu x jednostek na liniale, traktowanych jako krok. Sterownik musi posiadać zdolność sprawdzenia, czy falownik zatrzymał wrzeciono w zadanym punkcie, i ewentualnej korekty przed zadaniem kolejnego polecenia, albo musi wrzeciono bazować na krańcówce przed każdą kolejną operacją dla uniknięcia kumulacji błędów.