Nie zauważyłeś bo dla średnicy fi 65 - Vc (twoje S) 400 to już jest prawie 2000 obr/min
To co Ci się miało zmienić jak dałeś ograniczenie na 1000 ??
A jak ty nie pamiętasz czy wpisałeś G1 czy G0 to ja Ci nie będę tłumaczył o co chodzi z G3

Po pierwsze.. napisz jaką masz maszynę.. niektóre maszyny mają przekładnie i na samym początku musisz wybrać nr przełożenia (od tego zależy jakie masz max obroty)
Po drugie.. przed G96 musisz ograniczyć maksymalne obroty do jakiejś prędkości czyli
LIMS=2000
I w końcu najpierw wybierasz funkcję G96 która jest modalna a później dopiero wpisujesz jaką chcesz mieć prędkość skrawania.. najlepiej zrobić to w jednej lini
...................
G96 S200 M3
.................