Do kostek najlepsze jest imadło maszynowe, jeszcze lepiej precyzyjne. Samocentrujące? Po co? Do ustawienia kup czujnik zegarowy jak ci napisałem, może rzeczywiście na początek może ze 2-3 bo jak nie masz pojęcia to szybko "zużyjesz" te dość czułe na traktowanie przyrządy. Kup do nich od razu podstawkę magnetyczna taką żeby ci pasował do wrzeciona jej magnes. Coś w tym guście http://www.imbth.com.pl/prod,827,812-2- ... yczna.html tylko poszukaj tańszej gdzie indziej.
Chodzi o rozmiary tej kostki z magnesem na dole.

Jeżeli to kostka aluminiowa to proponuję użyć czujnika zegarowego. Taki o zakresie pomiarowym 10mm i dokładności 0,01mm będzie aż nadto do twoich celów.
Żeby napisać coś dokładniej musisz postawić konkretny problem.
A wiec... czekam na pytanie.