Kolego bardzo prosta sprawa:

Os X zapewne ma duzo mniejsza ilość kroków na mm czyli "step per / mm" wiec daje sie wpisać te 13000 natomiast Z ma pewnie dużo więcej kroków więc częstotliwość impulsów jest ograniczona tzn np założone przykladowe wartości :

Oś X - 50steps x 130000 =650 000imp
Os Z - 300steps x 1083.33 =650 000imp

Jak widać powyżej jedna os przy takiej samej ilości impulsów rozpędzi sie do 13m/min a druga tylko do 1083m/min...
wartości położone jakiekolwiek tylko do zobrazowania problemu różnic prędkości.

Jeśli chcesz przyspieszyc Zke zmniejsz podział kroków to raz a dwa spróbuj przestawić w MACH kernal speed na więcej o ile komp da rade - oczywiście jeśli sterowanie masz po LPT.