w sumie nie ma to znaczenia, problemy zaczynają się gdy potencjały mas są różne.
po prostu musisz tylko uważać żeby zasilacz płyty głównej nie zrobił Ci jakiegoś przebicia i dał + na masę. Prościej i taniej było by użycie +12 i +5 z zasilacza komputerowego, napięcie jest idealne, wydajność prądowa wystarczająca, do tego mniej zmartwień.