Najprostsza metoda to dopisać sobie.

Na przykład w jakimś w miarę dobrym edytorze za pomocą znajdź i zastąp. Znajdź linię w której jest X oraz Y i na końcu dopisz Z (taki skrypt w awk można napisać). Tylko nie wszędzie to Z jest potrzebne, wystarczy przecież Z ustawić przed każdym elementem, popatrz jak wygląda twój plik, znajdź jakiś charakterystyczny element w strukturze pliku, np. F... z prędkością jeśli zadawana jest przed każdym elementem albo przed i po przejeździe G0.
Możesz spróbować z DXF2GCODE. Tu przykład co tam w tym programie można robić: dxf2gcode-generator-subow-t107461.html