Spróbuj takie cos zrobic:

Ustaw maszyne na srodku pola roboczego, złap za jeden dzialajacy kontakt, np krancówke, wcisnij Ref All Home i nacisnij na ta krancówke 3 razy np z 2 sekundowa przerwa. Zobaczysz ze ci zbazuje i wyzeruje wszystkie osi jedną i tą samą krancówką.

Kontakty bazowe, krancówki, estop - mozesz je wszystkie razem połączyć seryjnie w jedno wejscie.
To ze kazdy kontakt podłączysz do innego pinu daje tylko to ze zostaje ci mniej wejsc na inne rzeczy.

Nie wiem co to jest zlacze ARK, ale wszystkie kontakty, bazowe, krancówki i estop maja byc polaczone z jednej strony do GND a z drugiej do wejsc 10, 11, 12, 13, 15 w Port 1.
Pewnie dlatego ci nie dziala bo gdzie indziej bazowe podlaczyles.

Moze nie zaznaczyles ze je masz w configu/input signals?
Albo polowe przylutowales jako normalnie zamkniete a druga otwarte? Lub activ high i low jest zle zaznaczone.

W okienku Diagnostics maja sie lampki zapalac jak nacisniesz na krancówke i sie wylaczyc jak puscisz.

Jak je masz podlaczone? Napisz cos wiecej.