Tak na szybko:
- wykonujesz linki geometrii elementów złożenia i na nich robisz dowolne operacje w tym również boolowskie. Tak wykonany model pozostanie asocjatywny
- wykonując substract mięzy elementami złożenia, przy polu tool zaznaczasz filtr wyboru "entire assembly". Tak wykonany model pozostanie nieasocjatywny.
- tzw "assembly features", jednak tutaj więcej nie napiszę, bo już chyba z 5 lat nie musiałem jej używać. Wykorzystuje się ją do wykonywania cech modelu w złożeniu. Tworzysz jakąś część w postaci no bez otworów, a otwory wykonujesz w złożeniu.

EDIT
Jak trafiłem, z którąś opcją i jest, a jest niezrozumiała, daj znać, filmik wrzucę.

EDIT 1
Assembly features to zestaw narzędzi dostępnych w CATII. Jak to się nazywa w NX to kompletnie już teraz zapomniałem ...
Jednak pewny jestem, że identyczne narzędzia występują również w NX, bo kiedyś ich używałem