podręcznik wysłałem. linku nie pamiętam

W podręczniku rozdział 5. Konfiguracja. Na stronie 44, rys.5-3, są opisane wejścia enkodera.

Nie znam mach'a, ale z komunikatu może wynikać że jakaś opcja kontroli obrotów wrzeciona jest włączona lub coś w tym stylu - program oczekuje na sygnał zwrotny. Czasem miałem takie efekty kiedy program otrzymywał sygnał z krańcówek, uruchomiałem program bez włączenia sterownika. Program ustawiał minmalną prędkość.
Możesz odpalić dos'a z dyskietki i program TurboCNC.

Pierwsze pytanie, jaki program, Master5CNC? Może sprawdź na innym.
Drugie, próbowałeś bez określania prędkości tzn G1 X50 Y50?